Em 2016, até a 12° semana epidemiológica, foram notificados no Maranhão 983 casos da doença, com 331 confirmações por sorologia. Enquanto isso, 496 notificações de zika foram registradas até o fim de março, com 220 casos confirmados clinicamente. O número de casos notificados de chikungunya no ano passado era de 434, com 138 foram confirmações.
Dos casos confirmados em 22 municípios maranhenses, 81% ocorreram na capital maranhense, o que corresponde a 271 confirmações. As outras cidades com registros da doença são: Alcântara (1), Apicum-Açu (2), Bacabeira (1), Cantanhede (2), Codó (2), Cururupu (1), Godofredo Viana (1), Itapecuru-Mirim (1), Matões (1), Miranda do Norte (2), Nina Rodrigues (1), Paço do Lumiar (5), Pedreiras (1), Rosário (4), Santa Rita (1), São José de Ribamar (9), São João do Paraíso (17), Senador La Rocque (1), Serrano do Maranhão (1), Vargem Grande (5) e Vitorino Freire (1).